고등학교 수학여행 중, 갑자기 이세계로 소환당한 다카토 요기리와 단노우라 토모치카. 함께 소환된 반 학생들은 현자에게 〈기프트〉를 얻었지만 거의 다 전멸해버렸다.

한편, 실은 원래부터 특수한 〈즉사능력〉을 갖고 있던 요기리, 그리고 단노우라류 궁술이라는 고대 무술의 달인이자 모코모코라는 강력한 수호령이 붙어 있는 토모치카는 멀쩡히 살아남아 원래 세계로 돌아가기 위한 여행을 계속하고 있었다. 그러던 중, 이 세계의 신 마루나리루나가 죽는 바람에 그녀들이 봉인했던 신들이 풀려나게 된다.

두 사람이 모으던 〈현자의 돌〉은 아기로 변하더니, 그 다음엔 소녀로 변해 여신이라고 주장하며 함께 여행을 하게 된 한편, 새로 등장한 여신은 이 세계의 생명을 모조리 죽이려고 하고 있었다!