멀고 먼 은하 저편…
지구 시간으로 약100년 정도 전에 흉악한 우주범죄자들을 가둬두었던 감옥에서 사고가 일어났다…

탈주한 우주범죄자들은 지구로 향하게 되고, 순진무구한 초등학생 키사라기 코유키는 감시자라는 수수께끼의 존재에게서 가디언의 힘을 부여받게 된다.

그녀의 사명은 신비한 힘으로 마법소녀로 변신해, 사악한 우주인들을 물리치는 것이다!

하지만 흉악한 우주인이 지구에 도착한 건 그로부터 5년 후의 일이었는데…