무지개 물고기가 은빛 비늘을 나눠 준 이후 친구가 된 물고기들은 모든것을 함께 하면서 행복한 나날을 보냅니다. 그러던 어느 날, 작은 줄무늬 물고기가 나타나 함께 놀자고 하지만 그는 따돌림을 당하고, 신나게 놀던 물고기들은 갑자기 상어의 공격을 받게 됩니다. 무지개 물고기와 친구들은 간신히 암초 틈새로 피하지만, 작은 줄무늬 물고기는 밖에 혼자 남게 됩니다. 어쩌면 그의 새 친구들과 자신의 목숨까지도 잃을지 모를 위험 속에서 무지개 물고기는 낯선 작은 물고기를 위해 과연 어떤 결단을 내릴까요?