아침 등굣길, 이카리 신지가 우연히 부딪힌 사람은 수수께끼의 전학생, 아야나미 레이…. 신지, 레이, 아스카, 이 세 명의 얽히고설킨 사랑의 ㅎ애방이 펼쳐진다!? '학원 에바', 드디어 시동!!