‘바티칸의 보물’ 전시회가 열리고 있는 뉴욕 메트로폴리탄 박물관. 중세의 템플 기사단원 복장을 한 괴한 네 명이 이곳을 습격한다. 그들은 이곳에 전시된 중세의 오래된 암호 해독기를 훔치고 유유히 사라진다. FBI 요원 션 라일리와 고고학자 테스 체이킨은 이 사건이 십자군 전쟁과 관련 있다는 사실을 밝혀내고, 하나씩 비밀을 파헤쳐 간다. 수사가 진행되면서 두 사람은 템플 기사단이 남긴 거대한 수수께끼와 맞닥뜨린다. 그리고 2천 년 동안 왜곡되어 온 기독교와 유대교, 이슬람교의 허위성, 성경의 비밀을 하나씩 벗겨내기 시작한다. 인간의 탐욕에 의해 왜곡된 종교의 순수성은 다시 회복될 수 있을 것인가?