17세기 영국의 위대한 설교자요 신학자로서 웨스트민스터 총회에서 요리문답을 직접 작성한 저자들 중 한 사람이다. 그는 복음주의 거장들이 많이 배출된 케임브리지 대학교 임마누엘 칼리지에서 공부했으며, 1639년에 문학사 학위, 1642년에 문학 석사 학위를 받았다.

왓슨은 학창 시절에도 명성을 누렸고, 졸업 후 런던의 중심인 월브룩의 성 스테반 교회의 목사가 되었다. 그곳에서 16년을 목회하다가 1662년 통일령이 통과되었을 때, 그는 그 교회에서 쫓겨났다. 그는 개인적으로, 헛간이든 가정집이든 숲에서든, 언제든지 설교를 계속했다. 벌금이나 투옥도 그의 복음 전파를 막을 수 없었다.

왓슨의 교리적 깊이, 표현의 명확성, 영성의 따뜻함, 적용에 대한 사랑, 그리고 예증의 은사는 설교자와 저술가로서의 왓슨의 명성을 드높였다. 왓슨은 1643년부터 1649년까지 열린 웨스트민스터 총회에서 요리문답 작성에 참여하였다. 그의 대표작은 『웨스트민스터 소요리문답 해설』이며, 그 외에 저서로는 『신학의 체계』(크리스챤다이제스트), 『팔복 해설』,『자족의 기술』, 『경건한 사람의 초상』, 『죄의 해악』.『십계명 해설』『주기도문 해설』, 『토머스 왓슨의 묵상』(CLC), 『경건』(복 있는 사람) 등이 있다. 그는 1686년 기도를 하던 중 소천하였으며, 목사였던 장인과 같은 무덤에 묻혔다.