1987년에 사제품을 받고 잠실·명동·마석·학동·상계동·가좌동 성당을 거쳐, 가톨릭영성심리상담소 소장으로 활동하고 있다. 나를 더 알고자 가톨릭대학교 상담 심리 대학원에서 영성 상담을 전공했다. 이후 영성 심리를 통해 심리적으로 불편했던 것들이 풀리는 경험을 했다. 이를 계기로 강연과 집필, 방송 활동을 하며 내적으로 힘들어하는 사람들을 위한 상담을 지속하고 있다.
또한 유튜브 채널 <홍성남 신부님의 톡 쏘는 영성 심리>에서 65개국 구독자들과 만나며, 페이스북과 다음 카페 <가톨릭영성심리상담소>에서도 활발히 소통 중이다.
저서로는 《나로 사는 걸 깜박했어요》, 《행복을 위한 탈출》, 《혼자서 마음을 치유하는 법》, 《홍성남 신부와 함께하는 마음 일기》 등이 있다.