현재는 24세기 우주. 마치 유니버설 솔저 같이 생긴 기계인간 집단인 보그가 우주연방을 침공하고는 지구를 향해가고 있었다. 우주전함 엔터프라이즈 E호의 피카드 선장(패트릭 스튜어트)은 한때 보그에게 끌려갔었다는 전력으로 중립지대에 머무르며 아무일없는 로뮬란족이나 감시하라는 명령을 받는다. 하지만 위험에 빠진 지구를 그냥 둘수가 없어 부하들의 동의를 얻어 상부의 명령에 불복종하고 전투에 참여를 한다. 마침 위기에 빠진 디파이언트호의 함장인 클링온인 워프를 구해내어 오랫만에 엔터프라이즈호 팀과 해후를 한다. 엔터프라이즈 E호의 가세로 강력해진 연방함대의 총력전으로 간신히 보그함대를 물리치지만 여왕 보그와 일부 보그들은 와륜을 타고 비상탈출을 한다.

그들은 시간여행을 통해 2063년 지구를 향해 가고 있었는데 다름아닌 그곳은 미국대륙 몬타나주의 그레넷섬이었다. 이곳은 2063년 4월4일 코크레인이 첫우주선을 발사하여 인류와 외계의 첫만남이 이루어진날인데 보그들이 이곳을 파괴하여 외계와의 만남을 방해하려는 것이었다. 엔터프라이즈호 역시 시간의 문을 통해 과거로 돌아가 우주의 역사를 뒤바꾸려하는 보그들을 물리치고 함장을 비롯한 몇몇 부하들과 피닉스호가 안전한지를 파악하기 위해 지상으로 내려간다.

하지만 2063년은 세계3차대전이 끝나 지구 곳곳이 페허로 변한 상태로 현 지구인들은 미래에서 날아온 피카드 일행의 이야기를 믿으려 하지 않는다. 고주망태인 코크레인(브렌트 스파이너) 박사 조차도 피닉스호의 발사가 인류사에 얼마나 큰 공헌을 한 역사적인 일인지를 알지 못한다. 거기 에다가 궤멸된줄 알았던 보그일당이 격전을 벌이다가 손상된 보호막을 통해 엔터프라이즈호로 잠입하여 승무원들까지 동화시켜가고 있었다. 전함에 이상현상이 벌어지고 좀비 기계인간들이 온 우주안을 돌아다니며 점차 장악을 해나가자, 위기의식을 느낀 피카드 함장은 부함장(조나단 프레이크스)과 몇몇을 지구에 남기고 우주선으로 돌아간다.

한편 보그 퀸에게 잡힌 데이터는 사지를 묶인채 고문을 당하기도 하고 피부를 인간처럼 만들어주겠다고 회유를 해가며 우주선의 비밀번호를 알아내려고 한다. 심지어는 로보트인 데이터에게 성적인 유혹까지 해가며 보그 퀸은 적극적으로 다가간다. 그리고 피카드는 오랜 고민끝에 우주선을 버리기로 하고 승무원들을 내보내고 보그들을 우주선과 함께 파괴시키겠다는 계획을 세운다. 마지막으로 퀸에게 잡혀있는 데이터를 구하러 갔지만 데이터는 이미 퀸에게 넘어가 그녀의 부하가 된듯하다. 이제 모든것이 끝났는가 보다고 생각했지만 오히려 데이터의 기지로 목숨을 건진다.

지구에서는 부함장과 일행들은 코크레인이 이상없이 피닉스호를 발사할수 있도록 물심양면으로 돕는다. 결국 지구에서 발사된 피닉스호는 광속비행에 성공을 하고 무사히 귀환을 한다. 그리고 우주조사단이 나타나 지구인과의 첫만남이 이루어지게 된다. 흡족한 마음으로 지구인들과 헤어지고 다시 우주로 향한다.

<터미네이터>의 기계인간들 같기도 하고 <유니버설 솔저>에 나오는 전사들 같기도 한 보그인들이 인상적이었다.그것도 좀비로 변한 모습이 섬찟하다. 지구인과 외계와의 첫만남을 지키려고 시간 여행까지 감행하고 피카드는 자신의 보그와의 악연까지 해결한다. 이번에도 명령 불복종때문에 질책을 받기는 하겠지만 일을 훌륭히 완수하였기에 어느 정도는 완화되리라고 생각한다. 1편에서 6편에서는 커크 선장과 스팍이 중요한 위치를 차지 하지만 7편이후에는 피카드 선장과 데이터가 그의 명맥을 이어가는듯하다.

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