탐정학원에 첫 등교한 큐를 비롯한 Q클래스 5명. 그날 당장 단 학원장에게 받은 임무는 산속의 두마을에서 일어난 불가사의한 실종사건 '인간소실'의 수수께끼를 푸는 것이었다. 마을을 찾아간 5명은 구 일본군의 보물전설과 역신교라는 기묘한 종교에 얽힌 이상한 소문을 듣는다. 그리고 '인간소실 살인'이 일어난다.