찰스 자비에르가 죽었다.
자비에르가 20년 전 과거, 시간의 꼬임 속에서 사망한다. 그리고 지금, 그가 없는 세상은 악몽이었다!
아포칼립스의 무자비한 철권이 지배하는 세계. 이곳에서는 오직 강한 자만이 살아남고, 약한 자는 도태된다. 그러나 그의 그림자 속에서 인간과 뮤턴트의 자유를 위해 싸우는 이들이 있었으니… 바로 자비에르 교수의 옛 친구 매그니토가 이끄는 엑스맨이었다! 지금은 지워진 마블 유니버스의 유일한 생존자 비숍과 마주한 현 세계의 엑스맨은 거짓 무덤에 묻힌 진실을 알게 되고, 잘못된 역사를 바로잡기 위해 온 우주의 운명을 건 싸움을 시작한다. 그러나 그들의 힘은 미약했으니… 과연 엑스맨은 아포칼립스와의 싸움에서 승리하고 뒤틀린 시간을 바로잡을 수 있을까?