'금문의 변'에서의 공적을 인정받아 점차 막부의 정예부대가 되어가는 신선조. 대대가 확대되면서 신입대사 모집을 위해서 토도우 헤이스케가 에도로 떠난 후, 대폭적인 편성 변경이 시행되는데...?! 드디어 제2기라 할 수 있는 변화기에 돌입하는 신선조에서 세이자부로와 소우지는?! 그리고 사이토는...?!