이 책은 총 6부 24개의 장으로 구성하였고, 부록에는 개정된 의료기관회계기준과 한국채택국제회계기준(K-IFRS)에 따라 변경된 재무제표, 그리고 국가공인 병원행정사 자격시험 대비 예상문제를 수록하였다. 제1부에서는 병원회계학의 학습에 필요한 회계의 기초지식을 다지며, 의료기관회계의 특성을 이해하는 단계이다. 회계의 기초(1장), 비영리조직의 회계(2장), 병원회계의 특성(3장), 미국의 영리병원회계(4장)를 설명하였다. 제2부에서는 회계의 기술적 구조와 순환과정을 다루었다. 거래가 발생하면서부터 재무제표가 작성되기까지 회계처리 전과정을 사례를 통해 서술하였다. 부기와 회계의 순환과정(5장), 거래(6장), 계정과 분개(7장), 장부와 기장(8장), 결산(9장)으로 구성되어 있다. 이 과정을 공부하고 나서 연습문제를 풀어보면 재무제표를 체계적으로 이해함은 물론 작성할 수 있는 능력을 갖추게 될 것이다.
제3부에서는 계정과목별 회계처리 방법을 자세히 설명하였다. 앞서 2부의 재무제표 작성시 다루었던 각 계정과목별로 인식, 측정기준, 기록방법에 대해 보다 심도있게 기술적인 면과 이론적인 면을 보강하였다. 현금·예금·유가증권(10장), 어음거래(11장), 의료미수금(12장), 기타채권과 채무(13장), 재고자산(14장), 유형자산과 무형자산(15장), 리스회계(16장), 자본(17장), 재무제표분석(18장) 등으로 구성하였다. 그리고 각 장 말미에 연습문제와 해답을 수록하여 학습한 내용을 바로 확인하고, 응용할 수 있도록 했다.
제4부에서는 병원원가관리회계를 다루었다. 환자로부터의 의료수익이 주 수입원인 병원에서 환자만족 경영은 병원의 존속과 발전에 필수적이다. 환자만족 경영이란 환자의 금전적 부담을 최소화하면서 최대의 서비스를 제공하는 것이라고 했을 때 결국 병원이 환자만족 경영을 통해 적정이윤을 창출하기 위해서는 원가계산에 기초한 합리적인 원가관리가 필수적이다. 최근 대형병원을 중심으로 원가분석정보에 입각한 경영을 해야 한다는 인식이 높아지고 있고, 원가분석정보시스템을 도입하는 병원이 생겨나고 있다. 이 책에서는 병원원가관리회계의 기초(19장), 병원의 원가계산(20장)을 설명하였다. 제4부의 학습만으로 병원원가계산의 능력을 갖추기에는 한계가 있을 것이다. 그러나 이 책은 병원회계학의 개론서로서 병원원가관리회계에 대한 기본적인 개념과 계산방법을 소개하는 것에 중점을 두었다.
제5부는 병원세무회계를 설명하였다. 병원세무회계는 앞에서 설명한 병원재무회계와 병원원가관리회계를 바탕으로 병원회계의 손익을 조정하여 과세소득을 계산하는 것이다. 세무회계는 각종세법, 법령 등과 밀접하게 관련되어 있고 다루어지는 내용도 적지 않다. 그러나 이 책은 병원회계학의 개론서로서 병원관련 세무회계의 모든 내용을 다루는 데는 무리가 있다. 따라서 이 책은 세무회계에 대한 기초개념(21장)과 병원세무회계의 특성과 실태(22장)를 간단히 설명하는데 초점을 두었다.
제6부는 의료기관회계의 전산화를 설명하였다. 오늘날 대부분의 기업과 의료기관들이 회계정보의 종합적이고 체계적인 관리와 신속한 처리를 위해 회계업무에 전산화(자동화)시스템을 도입하고 있다. 특히 최근에는 ERP(전사적자원계획)시스템을 도입하여 기존의 병원정보시스템인 OCS(처방전달시스템)과 전자의무기록(EMR) 등과의 접목을 통해 진료, 원무, 구매, 회계, 재무, 인사 등 의료기관의 모든 업무와 지원을 통합관리, 계획하는 경영시스템으로의 전환하고 있는 추세이다. 이 책은 회계전산화의 기념개념 소개에 초점을 두고 회계전산화의 기초(23장)와 회계와 ERP시스템(24장)을 간단히 설명하였다.