못 말리는 주인공 팽 박사가 노벨동물학상을 받겠다며 시작된 세계 생태 탐험은 1권 동물편에 이어 2권 식물편, 3권 곤충편으로 이어집니다. 팽 박사의 생태 탐험 시리즈는 지구상에 존재하는 동식물, 곤충 등이 먹이사슬로 단단히 연결되어 있는 모습을 보여 줌으로써 생태계 보전이 얼마나 중요하고 필요한 일인지 깨닫게 하고, 동물, 식물, 곤충이 지구상에서 얼마나 위대한 역할을 하고 있으며, 또 인간과 자연이 공존하기 위해 자연 생태에 대한 바른 이해와 지식이 필요함을 깨닫게 합니다.
평생 조수 노릇을 하느니 차라리 할아버지네 양봉 일을 돕겠다며 떠나 버린 지나를 찾기 위해 몰래 할아버지네 양봉장을 찾은 팽 박사는 꿀벌 실종 사건의 범인으로 오해를 받게 돼요. 도둑 누명을 벗고 할아버지로부터 벗어나기 위한 방법은 단 하나! 무슨 수를 써서라도 꿀벌이 실종된 원인을 밝혀내야만 해요. 꿀벌 실종 사건을 해결하기 위한 팽 박사의 못 말리는 곤충 탐험을 따라가다 보면, 지구상에서 점점 사라지고 있는 다양한 곤충들의 이야기를 만날 수 있어요. 과연 팽 박사는 꿀벌 실종 사건을 해결할 수 있을까요?