20XX년, 인류 중에서 갑자기 출현한 능력자들…
어떤 자는 육체를 변이시키고, 어떤 자는 초현실적인 힘을 휘둘렀다.
사람들은 그들을 가리켜 ‘얼터드(변이체)’라고 했다…!

진과 레이의 형제 대결로부터 반년 후.
‘AREA D’로 향하는 호송선에 한 소년이 잠입해 있었다…
소년의 이름은 하자마 료.
잠입공작원인 그가 받은 명령은… 놀랍게도 카자라기 진의 살해!
수수께끼의 섬을 둘러싼 이야기는, 새로운 스테이지로 돌입!!!