『독도와 한일관계』는 2008년 8월 독도연구소가 출범한 이후 독도연구소 연구위원들이 집필한 두 번째 연구서로, 독도 관련 문제를 둘러싼 한일관계를 집중적으로 조명한다. 이 책에는 국제법, 정치학, 역사 분야의 글 다섯 편이 실려있으며, 이를 바탕으로 독도 문제를 보다 다양한 시각에서 살피고 역사적 사실관계에 대한 정확한 진단과 분석을 통해 진실을 들여다볼 수 있도록 한다. 특히 책에서는 구체적이고 객관적인 자료를 제시해 역사적 사실들을 보다 가까이 느껴볼 수 있게 하며, 세 편이 수록된 국제법 관련 글들은 독도와 관련한 해양법적 접근과 국내법 체계 분석을 통해 영토 문제 등에 대한 이해를 도모한다.