연금술사 조직 D에 소속돼 있던 타카미야 세이쥬는 인조 천사 샤나의 목숨을 구하기 위해 D를 적대시하는 C에 들어가게 된다. 친구와의 이별, 소용돌이치는 애증... 어둠에 갇힌 운명 속에서 세이쥬와 사이가는 빛을 찾아 헤매는데...