《도쿄》가 변한 지 2년─ 고등학생인 아키즈키 렌지와
인기 아이돌 유미이에 카나타에게는 둘만의 비밀이 있었다.
두 사람은 《임계 구역·도쿄》에 침입하는 《침입자》였던 것이다.
에어리어 내에서만 발동하는 특수 능력 《주입》을 사용해
탐색을 이어 나가는 렌지와 카나타.
정부 기관 《구무청》과, 에어리어 최악의 괴물 《EOM》과의 삼파전 상황에서
렌지와 카나타는 맹세한 《약속》을 지킬 수 있을 것인가?!
인류 vs. 인류의 적─ 희망과 절망의 보이 미츠 걸 시동!!