2005년에 성균관대 유교문화연구소에서 출간한 『조선조 주자학의 철학적 사유와 쟁점』의 속편으로 전편과 마찬가지로 조선조 주자학에 대한 사유와 논쟁에 관한 전반적인 내용이 담겨있다. 다만 전편 출간당시 그 부피가 너무 많아 미처 함께 담지 못했던 내용들을 엮어 새로운 내용을 접해볼 수 있다. 특히 주자학의 도입과 불교와의 교섭 및 공존, 그후 조선 초기 주자학의 불ㄹ교에 대한 이념적 공격, 그것에 대한 종교학적 고찰도 함께 맛볼 수 있다. 또한 부록으로는 퇴계와 율곡에 대한 연구사를 첨부하였다.