인류 구제를 꿈꾸는 자 vs 이를 막으려는 자
마지막 결전의 때가 임박했다──!!

‘흑’의 어새신, ‘잭 더 리퍼’의 마스터 리쿠도 레이카의 손에 빈사지경에 처한 호문쿨루스 지크는 이유도 모르는 채로 부활했다. ‘흑’의 어새신을 쫓아간 룰러, 잔 다르크는 뜻밖의 반격에 직면하고, 한편으로 지크는 이 싸움에서 제시된 한 가지 사실 앞에서 인간이란 존재를 어떻게 볼지 고민하기 시작하는데──.

마지막 싸움이 임박하고, 살아남은 서번트, 그리고 마스터들도 여러 결단에 내몰린다. 결전의 장소는 대성배를 격납한 거대 보구「행잉가든즈 오브 바빌론」.제3차 성배전쟁에서『Fate/stay night』『, Fate/Zero』와 분기된 성배전쟁 외전. 룰러로 소환된 잔 다르크와 아마쿠사 시로 토키사다는 세계의 구제를 둘러싸고, 결코 패배할 수 없는 싸움에 임한다──!