과학과 추리를 결합한 『어린이 과학 형사대 CSI』 시리즈는 과학의 각 분야에 정통한 어린이 형사들이 사건을 수사하는 과정을 통해 물리, 화학, 생물, 지구 과학에 걸쳐 교과서에 등장하는 주요 과학 원리를 알려주고, 사고력을 길러 주는 과학 추리 동화입니다.

교토 CSI 나무하라 국장의 초청을 받고 일본을 방문하게 된 CSI 2기. 일본의 오래된 전통 여관에 묵게 된 아이들은 미스터리한 사건과 맞닥뜨리게 됩니다. 과연 CSI 2기는 사건을 해결하고 선배들의 명성을 이어 갈 수 있을까요? 한편, 일본에 간 CSI를 부러워하던 장원소, 송화산, 최운동, 소남우는 자신들만의 힘으로 수사해야 할 첫 사건을 맡게 됩니다. 걱정 반, 기대 반으로 시작한 수사는 자꾸 꼬이기만 하는데…….
네 아이들은 자신들의 능력을 믿고 엉킨 실타래 같은 사건을 해결할 수 있을까요?