사라진 ‘그릇’을 찾기 위해, 수수께끼의 조직 ‘카라’가 움직이기 시작했다. 한편, 그때 보루토는 나루토와 닌자대련을 하고 있었는데, 나루토가 오른손에 과학닌자도구를 장착한 걸 알고 분개하게 된다. 그런 보루토에게 새로운 임무가 주어지는데…?! 다시금 재앙이 닥쳐오고 있다!!