돌연, 세계 각지에 ‘안개의 함대’라 불리는
의무의 초병기를 탑재한 전함들이 출현.
인류는 그 함대에 속절없이 패전하며 해상에 나갈 수 없게 된다….
그 해전 이후 17년. 어떻게 된 영문인지
‘안개’의 잠수함 ‘01401’에 올라탄
치하야 군조와 그 동료들을 ‘01401’의
인체화(멘탈 모델)인 이오나와 함께
안개의 함대를 상대로 싸움에 임하는데….