스도쿠는 뇌의 활동을 원활하게 하고 IQ를 향상시켜주는 최고의 두뇌계발 게임이다. 영국 정부가 발행하는 교육 잡지에서는 아이들의 두뇌 계발을 위해 스도쿠를 적극 활용할 것을 권장하고 있다. 또한 영국의 과학자들도 머리를 좋게 하는 방법의 하나로 스도쿠를 꼽는다.
스도쿠는 특히 논리적 사고와 집중력, 추리력을 향상시켜주는 게임으로 권장되고 있다. 스도쿠는 수리적 이해나 지식, 언어 능력과는 상관없이 논리적 사고로 푸는 퍼즐이므로, 정신을 집중해서 퍼즐을 하나씩 추리해나간다면 누구나 재미있게 풀면서 논리적 사고력과 집중력 등을 기를 수 있다.