세상에 잔존하는 마력의 위협에 대처하기 위해 ‘이단 심문관’을 육성하는 교육기관. 통칭 대 마도학원에는 열등생들만 모아놓은 부대, ‘제35시험소대’가 있다. 어느 날, 35소대원 중 한 명인 스기나미 이카루가가 돌연 학교에서 모습을 감춘다. 사실 그녀는 항마병기 개발회사인 알케미스트 사의 전직 연구원으로, 생물병기로 이용될 수 있는 마력 보유 환상생물인 ‘엘프’를 복원하는 계획의 열쇠를 쥔 인물인 듯한데….
사라진 이카루가를 쫓아 위험구역인 ‘경계선’으로 향하는 타케루 일행. 그런데 그곳에서 그들을 기다리고 있는 것은, 탐구심이라는 이름의 광기에 사로잡혀 나락으로 추락한 또 한 명의 ‘스기나미’였다.