마침내 재회한 엄마를 학원탈출 직전 폭발사고로 잃은 미캉. 그 무렵 학원에 침투한 「Z」에게서 학원을 지키기 위해 미캉은 초등부 교장의 관리하에 놓이고, 베어와 둘이 미로동에 유폐된다. 이윽고 찾아온 크리스마스. 필사적으로 미캉이 있는 곳을 찾아 헤매는 나츠메에게 크리스마스 밤의 기적이?!