성경적 상담은 다른 기독교 상담과 마찬가지로 교회에서 주로 이루어지는데 그 사역의 근거를 성경과 초대교회의 사역에서 찾는다. 사도행전에 보면 바울이 에베소교회의 장로들과 작별인사를 하면서 “그러므로 여러분이 일깨어 내가 삼년이나 밤낮 쉬지 않고 눈물로 각 사람을 훈계하던 것을 기억하라”(행20:31)고 말씀하고 있다. 에베소교회에서 그의 주된 사역은 설교도 부흥회도 아닌 개인사역 즉 한 사람 한 사람을 붙들고 간곡하게 훈계한 사역이었다. 이 사역을 일종의 성경적 상담이라고 볼 수 있겠다.
특정한 사람들(사도나 목회자)뿐만 아니라 모든 성도는 서로 위로와 권면을 하도록 부르심을 받았다. 데살로니가전서 5장 11절에 “그러므로 피차 권면하고 서로 덕을 세우기를 너희가 하는 것 같이 하라” 골로새서 3장 16절에는 “그리스도의 말씀이 너희 속에 풍성히 거하여 모든 지혜로 피차 가르치며 권면하고...”라고 말씀하고 있다. 그러므로 성경적 상담은 특정한 장소(상담실)에서 특별한 사람(전문가 혹은 목회자)이 상담을 구하여 찾아오는 사람만 상담해주는 것이 아니다. 때로는 상담이 필요한 사람도 찾아 나서는 상담이기도 하다.