「마법소녀」의 정체가 밝혀지고 사야카, 쿄코는 각자의 운명을 걸어가기 시작한다.
그것을 지켜보기만 할 수밖에 없는 카나메 마도카.
그래도 큐베는 마도카에게 속삭인다.
「마법소녀가 되어 주지 않을래?」
그것을 필샂거으로 막으려는 아케미 호무라의 이유는…?
그리고 마도카는 결국 자기의 마음과 어떻게 맞설까…?
마법소녀들의 운명 이야기, 대망의 완결편!!