『메가스터디 중학국어 비문학 독해연습 3』은 두 개의 지문이 하나의 STUDY가 되도록 구성하여, 학생들이 한 번에 학습하기 적절한 분량을 성취기준 구분에 따라 제시하는 효율적 학습 시스템을 적용하였다. 각 STUDY는 2015 개정 교육과정 독서 영역 구분을 반영하여 ‘인문+예술, 사회+문화, 과학+기술’과 최근 학력평가에서 출제되고 있는 형태인 ‘긴 지문’으로, 하나의 STUDY에서 두 개의 지문을 학습하되, 각 영역을 구분하여 제시하였다. 또한 각 영역에서 학생들이 흥미롭게 읽을 수 있는 내용을 엄선하여 지문으로 제시하였다.