대학을 졸업한 후 하나님의 부르심에 따라 신학교에 편입하였으며, 그 후 지속적으로 신학석사, 교육학석사, 목회학 박사학위를 취득하였다(연세대학교, 한세대학교, 아세아연합신학대학원, 연세대교육대학원, 미국 서든 뱁티스트신학대학원).

김봉준 목사는 여의도순복음교회에서 21년간 사역하며 소교구장, 대교구장, 순복음교육연구소장, 최자실기념금식기도원 강사 등을 거쳤다. 초대 청년국장과 주요 지교회 담임목사를 역임하였으며, 강남제2교회의 담임목사를 지냈다. 교무담당 부목사로 재임 중에는 조용기 목사께서 설교하시던 주일 4부 예배의 설교자로 뒤이어 헌신하기도 하였다.

김봉준 목사는 신학교에서 18년간 후학들을 가르치기도 하였는데, 한세대학교, 미국 서든 캘리포니아 신학원, 베데스다 신학대학원에서 강의했으며, 순복음신학원 학장, 동경신학대학 학장을 역임하였다.
두 차례 해외 선교사로 파송되어 하와이에서 순복음 호놀룰루교회를 설립했고 하와이 기독교TV방송 사장을 지냈으며, 일본 선교사 시절엔 일본 최대 교회인 동경순복음교회의 담임목사를 지내기도 했다. 한세대학교 겸임교수, 연세대학교 총동문회 이사, 동대학 교육대학원 총동창회 명예회장이며 한국교회언론회 공동대표, 미래목회포럼 대표, 한국교회봉사단에서 공동회장으로 한국교회를 섬기며 아홉길사랑교회의 담임목사로 있다.