2006년부터 국가재정법에 따라 본격적으로 추진되기 시작한 성인지예산제도는 법·제도적인 기반 확충에 있어서 상당한 발전을 이루었다. 그러나 정책의 실효성에 대해서는 여전히 문제점이 제기되고 있는 상황이다. 특히 도입초기부터 논란이 되었던 대상사업 선정기준 및 인센티브 등의 제도적 장치에 관해서는 여전히 합의를 찾지 못하고 있다. 본 연구는 이러한 한계를 극복하기 위해 합리적인 대상사업의 선정기준(안) 및 평가기준(안)을 개발하고자 하였다. 또한 개발된 대상사업 선정기준(안)을「2013년도 성인지예산서」에 적용하고, 평가기준을「2013년도 성인지예산서」및「2011회계연도 성인지결산서」에 적용하여 그 결과를 제시하였다.