R은 다른 통계 소프트웨어와 차별화되는 다양한 장점을 갖고 있는 반면 단점도 있습니다. R에서 사용할 수 있는 대부분의 분석기법들은 여러 분야의 수많은 사용자들에 의해서 작성되어 올려진다. 다양한 분석기법이 있다는 것은 더할 나위 없이 반가운 일이지만 현재 R에 어떤 분석기법이 있고 그 사용법이 무엇인지 알아내는 것은 상당히 번거로운 작업이며, R을 처음 접하는 초보 사용자들을 좌절하게 만드는 주된 요인이라고 할 수 있다.