이 책은 분자 구조식 그리는 방법, 명명하는 방법 및 반응 메커니즘 그리는 방법 등을 스스로 학습할 수 있도록 구성하였다. 즉, 하나의 주제에 대하여 1) 개략적인 개념 설명, 2) 단계별 수행 방법 3) 반복 학습에 따른 복습 및 연습문제 형식으로 구성되었다. 이 책은 모두 10개의 장으로 구성되어 있다. 1장과 2장은 화합물의 표현 방법 및 명명법을, 3장은 반응 메커니즘 그리는 방법, 4장부터 9장까지는 작용기를 중심으로 한 계열 화합물의 중요 반응 메커니즘을 다루었다. 마지막으로 10장은 대사 과정에서 중요한 생체 분자의 반응 메커니즘을 다루었다.