시간이 얼어붙어 영원한 밤이 이어지는 곳,
자정의 세상에 또다시 위기가 닥쳤다!
흘러 나가는 마법을 막기 위한 숨 막히는 대결
우리 모두가 기다린 판타지 대작, 그 두 번째 이야기

『미드나잇 아워 1. 자정에 갇힌 세상』에서 치러진 빅벤에서의 결전 이후, 에밀리는 사냥개로 변신하는 훈련에 열중하지만 마음처럼 되지 않는다. 그 바람에 난생처음으로 마주한 외할머니와 친척들 앞에서 크나큰 망신을 겪는다. 한편 자정의 세상 속 마법이 어디론가 조금씩 조금씩 흘러 나가는 심상찮은 일이 벌어지는데……. 자정의 세상을 지키는 비밀 요원, ‘도서관 사서’로 임명받은 에밀리는 마법이 새어 나가는 구멍을 조사하는 임무를 맡게 된다. 자정의 세상에서 펼쳐지는 신비스러운 모험, 그 두 번째 이야기가 시작된다!